Einige der Cook Inseln sind niedrige, durch Korallenriffe aber schwer zugängliche Inseln. Korallenriffe existieren sowohl in der Tiefsee als auch im Flachwasser bis zur Wasseroberfläche. Sie bilden die größten von Lebewesen geschaffenen Strukturen auf der Erde und sind Lebensraum für eine Vielzahl von Pflanzen und Tieren, beispielsweise Würmer, Weichtiere, Schwämme, Stachelhäuter und Krebstiere.
Die übrigen Inseln sind hoch und mit üppiger Vegetation bedeckt. Hier gedeihen Kokospalmen, Brotfruchtbaum und Pisang (Bananen).
Je nach Sorte und Standort werden Kokospalmen bis zu 30 Meter hoch. Die Krone der Pflanze besteht aus bis zu 5 Meter langen gefiederten Blättern. Aus den Blattachsen wachsen die verzweigten Blütenstände mit jeweils bis zu 40 weiblichen und über 10.000 männlichen Blüten. Der Baum trägt das ganze Jahr über Früchte, die in seiner Krone in Gruppen verschiedener Entwicklungsstadien wachsen, so dass reife Kokosnüsse ständig nachwachsen.
Der Brotfruchtbaum ist ein tropischer, immergrüner Baum, der zur Gattung der Maulbeergewächse gehört. Er ist ein mittelgroßer und breitkroniger Baum und kann eine Höhe bis zu 20 Meter erreichen. Der Durchmesser des graubraunen Stammes erreicht sechzig bis einhundert Zentimeter.
Die ganze Pflanze hat einen hautreizenden und milchigen Saft. Aus diesem Grund werden die Früchte oft durch Abbrechen mit langen Stangen geerntet.
Die nördliche Gruppe der Cook Islands besteht vorwiegend aus Atollen. Ein Atoll ist ein ringförmiges Korallenriff, das eine Lagune umschließt. Das Korallenriff bildet einen Saum von häufig äußerst schmalen Inseln, die nach dem polynesischen Wort für "Insel" meist als "Motu" bezeichnet werden.
Es sind bisher rund 100 Vogelarten auf den Cook Inseln registriert worden. 26 davon sind "echte" einheimische Brutvögel. Bei den übrigen handelt es sich um Zugvögel und umherstreifende Meeresvögel, welche den Inseln jeweils außerhalb ihrer Brutsaison einen Besuch abstatten.
Von den 26 einheimischen Brutvogelarten sind genau die Hälfte, nämlich 13, Meeresvögel - Tropikvögel, Tölpel, Fregattvögel und Seeschwalben. Die andere Hälfte setzt sich aus einem Reiher, einer Ralle, einer Ente, drei Tauben, einem Papagei, zwei Eisvögeln, einem Fliegenschnäpper, einem Segler, einer Grasmücke und einem Star zusammen.
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